時空に関連する特殊粒子が発見された未来世界。第三次世界大戦を生き抜いた孤高の凄腕傭兵・狭間夕陽（はざまゆうひ）は、天才少女科学者・鴛鴦契那（おしどりけいな）の秘密実験に参加する。しかしその直後、謎の襲撃者により、夕陽は契那ともども命を落としてしま…